SBRC 構造生物学研究センター

IMSS KEK

便利なリンク集

X線結晶構造解析

  • 結晶構造解析ソフトウェア(データ処理、構造解析)CCP4
  • 結晶構造解析ソフトウェア(構造解析)Phenix
  • 結晶構造解析ソフトウェア(データ処理)XDS
  • 回折イメージビュワー Adxv
  • 結晶構造解析 wiki biokids
  • 立体構造表示 PyMOL
  • 立体構造表示 UCSF Chimera

X線溶液散乱


データベース

  • タンパク質の立体構造データベース PDB
  • 電子顕微鏡による立体構造データベース EMDB
  • 出芽酵母のデータベース SGD
  • 出芽酵母TAP融合ORF株 Yeast TAP Tagged ORFs
  • 線虫のデータベース WormBase
  • 好熱性真核細胞生物のデータベース C. merolae Genome Project

配列解析

  • アミノ酸組成や吸光係数の計算 ProtParam
  • 相同性検索 BLAST
  • ペアワイズアラインメント BLAST2
  • マルチプルシークエンスアラインメント ClustalW2
  • 立体構造の相同性検索 Dali
  • ホモロジーモデリング Phyre2
  • 天然変性領域の予測 DISOPRED
  • 分子進化遺伝学の解析用ソフトウェア MEGA5

組換えDNA実験・タンパク質の精製・物理化学的分析

  • GEのバイオ実験の原理と方法 Technical Tips
  • オリゴDNA合成,人工遺伝子合成,DNAシークエンス Eurofin Genomics
  • N末端アミノ酸配列分析 APRO SCIENCE
  • ペプチドマスフィンガープリンティング Genomine