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X線結晶構造解析

• 結晶構造解析ソフトウェア（データ処理、構造解析）CCP4
• 結晶構造解析ソフトウェア（構造解析）Phenix
• 結晶構造解析ソフトウェア（データ処理）XDS
• 回折イメージビュワー　Adxv
• 結晶構造解析 wiki　biokids
• 立体構造表示　PyMOL
• 立体構造表示　UCSF Chimera

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X線溶液散乱

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データベース

• タンパク質の立体構造データベース　PDB
• 電子顕微鏡による立体構造データベース　EMDB
• 出芽酵母のデータベース　SGD
• 出芽酵母TAP融合ORF株　Yeast TAP Tagged ORFs
• 線虫のデータベース　WormBase
• 好熱性真核細胞生物のデータベース　C. merolae Genome Project

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配列解析

• アミノ酸組成や吸光係数の計算　ProtParam
• 相同性検索　BLAST
• ペアワイズアラインメント　BLAST2
• マルチプルシークエンスアラインメント　ClustalW2
• 立体構造の相同性検索　Dali
• ホモロジーモデリング　Phyre2
• 天然変性領域の予測　DISOPRED
• 分子進化遺伝学の解析用ソフトウェア　MEGA5

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組換えDNA実験・タンパク質の精製・物理化学的分析

• GEのバイオ実験の原理と方法　Technical Tips
• オリゴDNA合成,人工遺伝子合成,DNAシークエンス　Eurofin Genomics
• N末端アミノ酸配列分析　APRO SCIENCE
• ペプチドマスフィンガープリンティング　Genomine

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クライオ電子顕微鏡

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