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クライオ電顕

Last updated: 2024.03.13.

KEKクライオ電顕施設のミッション

KEKクライオ電顕施設は以下3点をミッションとして、Thermo Fisher Scientific社の200kVクライオ電子顕微鏡 Titan Krios G4 とTalos Arctica G2 (Falcon 4) を運用しています。
　1. アカデミア/企業ユーザーへのマシンタイム提供（年間200日以上！）
　2. グリッド凍結/データ測定の支援（必要に応じた単粒子解析支援）
　3. クライオ電顕実験に関する技術導入の支援

アカデミアユーザーの場合、KEKクライオ電顕はBINDS経由でご利用可能です。
□ KEKクライオ電顕BINDS課題 お申し込みはこちらから（*随時募集中！）
　 KEKクライオ電顕BINDS課題 申請例

□ KEK-Talos・外部ユーザー向け初期トレテキスト（ver.33）（*こちらが最新版！）
（ver.32） （ver.31） （ver.30） （ver.29） （ver.28） （ver.27） （ver.26） （ver.25） （ver.20）
□ KEK-Titan・外部ユーザー向け初期トレテキスト（ver.3）（*暫定版！）
□ KEK-Titan・外部ユーザー向け初期トレテキスト（ver.3）英語版（*暫定版！）
□ 筑波大-CRYOARM300II・外部ユーザー向け初期トレテキスト（ver.1）（*暫定版！）

□ 結晶学会誌に載せていただいたKEKクライオ電顕施設の紹介記事です。
　（*利用方法やGrid-prepのtipsをまとめてあります！）

施設利用・料金表

クライオ電顕利用の流れ
KEK-CryoEM_ProcessFlow.jpg

Titanご利用料金
　アカデミア　装置利用　　　3,000円/時間*（利用単位は9時間/日か24時間/日のいずれか）
　　　　　　　測定解析補助　無料
　企業　　　　装置利用　　　15,000円/時間（利用単位は24時間/日）
　　　　　　　測定解析補助　30,000円/時間（利用単位は8時間/日）

Talosご利用料金
　アカデミア　装置利用　　　2,000円/時間*（利用単位は9時間/日か24時間/日のいずれか）
　　　　　　　測定解析補助　無料
　企業　　　　装置利用　　　10,000円/時間（利用単位は24時間/日）
　　　　　　　測定解析補助　30,000円/時間（利用単位は8時間/日）

*消耗品実費相当の金額となっています（グリッド・C-clip・C-clipリング・ろ紙・液体窒素・HDDなど）。ユーザーの皆様のご協力に心より感謝申し上げます。
**企業ユーザーのご利用方法としては、上記の単発の施設利用（企業コンソへの入会が必須）の他に、学術指導契約/共同研究契約（企業コンソにもご入会いただけます）などのバリエーションがあります。詳細は担当：増田（cmasuda@kek.jp）までお問い合わせください。

大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構研究施設利用規程
研究施設利用規程（平成２８年規程第６４号）

クライオ電顕利用の規定
クライオ電子顕微鏡利用要項
クライオ電子顕微鏡利用約款

測定に伴うご提出書類
測定する際には、クライオ電顕コンソーシアムへのご入会をお願いしております。

申請書（原則利用日の10日前に御提出をお願いします。 ）
　　　　　□ 施設利用申請書（アカデミア用）
　　　　　□ 施設利用申請書（企業用）
遺伝子組換え体使用届
　　　　　□ 遺伝子組換え体使用届
報告書（利用後速やかにご提出ください。）
　　　　　□ 施設利用時間報告書(アカデミア用)
　　　　　□ 施設利用時間報告書(企業用：オプション利用あり)

KEKクライオ電顕の歩み

2018年度〜2021年度 ▼ 2018年度
　04月　AMEDの支援でKEKに導入されたクライオ電子顕微鏡が稼働開始
　05月　外部ユーザー向け初期トレ テキスト作成開始
　05月　第1-3回外部ユーザー向け初期トレ（*KEKユーザーを対象に不定期開催）
　09月　PF研究会（X線とクライオ電子顕微鏡で挑む生命の機能とかたち）
　10月　KEKクライオ電顕BINDS課題へのマシンタイム配分開始
　11月　企業向けお試し測定開始（13社が参加）
　12月　第1回クライオ電顕解析初心者講習会@KEK
　03月　第1回クライオ電顕ネットワークUGミーティング@東大

2019年度
　04月　施設利用料制度開始
　04月　第4-8回外部ユーザー向け初期トレ
　04月　KEKクライオ電顕コンソーシアム設立
　05月　第2回クライオ電顕解析初心者講習会@KEK
　06月　クライオ電顕勉強会発足
　11月　microED同好会発足
　12月　第2回クライオ電顕ネットワークUGミーティング@分子生物学会
　01月　第9-12回外部ユーザー向け初期トレ
　02月　第3回クライオ電顕解析初心者講習会@KEK

2020年度
　06月　zoom接続によるリモート実験を本格的に開始
　11月　第13-14回外部ユーザー向け初期トレ
　11月　アカデミア向けお試し測定開始（17グループが参加）
　12月　第3回クライオ電顕ネットワークUGミーティング@分子生物学会
　02月　第4回クライオ電顕解析初心者講習会@KEK（オンライン）
　03月　EPU-D導入

2021年度
　04月　TCEFの立ち上げ
　08月　アカデミア向けお試し測定（3グループが参加）
　08月　クライオ電顕実験棟建設開始
　10月　検出器をFalcon3ECからFalcon4にupgrade
　10月　第15-16回外部ユーザー向け初期トレ
　12月　第4回クライオ電顕ネットワークUGミーティング@分子生物学会
　03月　第5回クライオ電顕解析初心者講習会@KEK（オンライン）
　03月　クライオ電顕実験棟完成
　03月　Talosをクライオ電顕実験棟に移設



2022年度
　05月　第7回OTAクラブ単粒子解析計算処理の中・上級者の集まり
　06月　第6回クライオ電顕解析初心者講習会〜データ処理〜
　09月　第8回OTAクラブ単粒子解析計算処理の中・上級者の集まり
　10月　第7回クライオ電顕解析初心者講習会〜データ処理〜
　12月　第5回クライオ電顕ネットワークUGミーティング@分子生物学会
　12月　300kVクライオ電顕（Titan Krios G4）導入

2023年度
　06月　Titanのユーザー利用を開始

Activity Report

KEK-CryoEM_Vol.5.jpg

KEKクライオ電顕カレンダー

【2018年〜2024年度のカレンダーはこちらをクリック】


2025年4月

Date - Talos Titan
4/1 火 未定_1日枠 未定_1日枠
4/2 水 未定_1日枠 未定_1日枠
4/3 木 未定_1日枠 未定_1日枠
4/4 金 未定_3日枠 E2_農研機構_阿久津（BINDS#4643）
4/5 土 未定 未定
4/6 日 未定 未定
4/7 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
4/8 火 未定_1日枠 未定_1日枠
4/9 水 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
4/10 木 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
4/11 金 未定_3日枠 E2_藤城_埼玉大（BINDS#5342）
4/12 土 未定 ↓E2
4/13 日 未定 ↓E2
4/14 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
4/15 火 未定_1日枠 未定_1日枠
4/16 水 未定_1日枠 未定_1日枠
4/17 木 未定_1日枠 企業測定（エ）
4/18 金 未定_3日枠 E2_野中_都医学研（BINDS#6147）（来所）.
4/19 土 未定 未定
4/20 日 未定 未定
4/21 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
4/22 火 企業測定.（_ア新） E2_千葉大_村田（BINDS#5790）
4/23 水 E1_東京理科大_白石（BINDS#6150） ↓E2
4/24 木 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
4/25 金 E1_学習院大_永江（BINDS#7004） 企業測定（_ジ）
4/26 土 未定 企業測定（_ジ）
4/27 日 未定 未定
4/28 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
4/29 祝火 休止 休止
4/30 水 休止 休止

2025年5月

Date - Talos Titan
5/1 木 休止（コンディショニング） 休止（コンディショニング）
5/2 金 休止（シャットダウン） 休止（シャットダウン）
5/3 祝土 休止 休止
5/4 祝日 休止 休止
5/5 祝月 休止 休止
5/6 祝火 休止 休止
5/7 水 メンテナンス（再立ち上げ） メンテナンス（再立ち上げ）
5/8 木 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
5/9 金 E1_京大_清水（BINDS#6582） E2_千葉大_村田（BINDS#5790）
5/10 土 ↓E1 未定
5/11 日 ↓E1 未定
5/12 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
5/13 火 E1_京大_宮川（BINDS#5190）（remote） E2_野中_都医学研（BINDS#6147）（来所）.
5/14 水 E1_第18回初期トレ（外部ユーザー） ↓E2
5/15 木 E1_第18回初期トレ（外部ユーザー） 企業測定（エ）
5/16 金 E1_第18回初期トレ（外部ユーザー） E2_千葉大_村田（BINDS#5790）(remote?)
5/17 土 未定 未定
5/18 日 未定 未定
5/19 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
5/20 火 未定_1日枠 E2_東邦大_後藤（BINDS#3205）(remote?)
5/21 水 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
5/22 木 E1_産総研_山崎（BINDS#2986） 企業測定（_ジ）
5/23 金 E1_東京理科大_白石（BINDS#6150） E2_千葉大_村田（BINDS#5790）(来所)
5/24 土 未定 未定
5/25 日 未定 未定
5/26 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
5/27 火 未定_1日枠 E2_野中_都医学研（BINDS#6147）（来所）.
5/28 水 未定_1日枠 ↓E2
5/29 木 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
5/30 金 未定_3日枠 企業測定（_ジ）
5/31 土 未定 企業測定（_ジ）

2025年6月

Date   Talos Titan
6/1 日 未定 企業測定（_ジ）
6/2 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
6/3 火 未定_1日枠 E2_産総研_山崎（BINDS#2986）
6/4 水 未定_1日枠 企業測定.（_ア）
6/5 木 未定_1日枠 E2_野中_都医学研（BINDS#6147）（来所）.
6/6 金 未定_3日枠 ↓E2
6/7 土 未定 未定
6/8 日 未定 未定
6/9 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
6/10 火 未定_1日枠 E2_京大_宮川（BINDS#1678）（remote?）
6/11 水 未定_1日枠 企業測定（エ）
6/12 木 未定_1日枠 企業測定.（_シ ）
6/13 金 未定_3日枠 E2_千葉大_村田（BINDS#5790）(来所)
6/14 土 未定 未定
6/15 日 未定 未定
6/16 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
6/17 火 未定_1日枠 企業測定.（_ア）
6/18 水 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
6/19 木 E1_野中_都医学研（BINDS#6147）（来所）. 企業測定（_ジ）
6/20 金 ↓E1 E2_藤城_埼玉大（BINDS#5342）（remote?）
6/21 土 未定 ↓E2
6/22 日 未定 ↓E2
6/23 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化
6/24 火 未定_1日枠 企業測定（エ）
6/25 水 未定_1日枠 企業測定（エ）
6/26 木 未定_1日枠 企業測定（_ジ）
6/27 金 未定_3日枠 企業測定（_ジ）
6/28 土 未定 企業測定（_ジ）
6/29 日 未定 企業測定（_ジ）
6/30 月 メンテ（EC gain ref）& 高度化 メンテ（EC gain ref）& 高度化

KEKクライオ電顕を利用して出版された論文

KEKユーザーとの共同研究の成果
□ Effect of alkali metal cations on the unilamellar vesicle of a squalene bearing 18-crown-6.
Linh, T.N., Arimura, T., Tominaga, K., Isoda, H., Kawasaki, M., and Adachi, N. ACS Omega Online ahead of print (2023).

□ Uphill energy transfer mechanism for photosynthesis in an Antarctic alga.
Kosugi, M., Kawasaki, M., Shibata, Y., Hara, K., Takaichi, S., Moriya, T., Adachi, N., Kamei, Y., Kashino, Y., Kudoh, S., Koike, H. and Senda, T. Nature Commun. 14, 730 (2023).
EMDB-35080@3.13Å(PDB:8HW1) (EMPIAR-)

□ Reversible Assembly of an Artificial Protein Nanocage Using Alkaline Earth Metal Ions.
Ohara, N., Kawakami, N., Arai, R., Adachi, N., Moriya, T., Kawasaki, M., and Miyamoto, K. J. Am. Chem. Soc. Online ahead of print (2022).
EMDB-33289@3.96Å (PDB:7xm1) (EMPIAR-)

□ Structural basis for activation of DNMT1.
Kikuchi, A., Onoda, H., Yamaguchi, K., Kori, S., Matsuzawa, S., Chiba, Y., Tanimoto, S., Yoshimi, S., Sato, H., Yamagata, A., Shirouzu, M., Adachi, N., Sharif, J., Koseki, H., Nishiyama, A., Nakanishi, M., Defossez, P.A., and Arita, K. Nature Commun. 13, 7130 (2022).
EMDB-33200@2.52Å @TokyoU-Titan (PDB:7xi9)
EMDB-33201@2.23Å @TokyoU-Titan (PDB:7xib)

□ Structural bases for aspartate recognition and polymerization efficiency of cyanobacterial cyanophycin synthetase.
Miyakawa, T., Yang, J., Kawasaki, M., Adachi, N., Fujii, A., Miyauchi, Y., Muramatsu, T., Moriya, T., Senda, T., and Tanokura, M. Nature Commun. 13, 5097 (2022).
EMDB-32381@2.91Å (PDB:7wac) (EMPIAR-)
EMDB-32382@2.96Å (PDB:7wad) (EMPIAR-)
EMDB-32383@2.64Å @TokyoU-Titan (PDB:7wae)
EMDB-32384@2.52Å @TokyoU-Titan (PDB:7waf)

□ Core fucose-specific Pholiota squarrosa lectin (PhoSL) as a potent broad-spectrum inhibitor of SARS-CoV-2 infection.
Yamasaki, K., Adachi, N., Ngwe Tun, M.M., Ikeda, A., Moriya, T., Kawasaki, M., Yamasaki, T., Kubota, T., Nagashima, I., Shimizu, H., Tateno, H., and Morita, K. FEBS J. in press (2022).

□ Discovery of non-squalene triterpenes.
Tao, H., Lauterbach, L., Bian, G., Chen, R., Hou, A., Mori, T., Cheng, S., Hu, B., Lu, L., Mu, X., Li, M., Adachi, N., Kawasaki, M., Moriya, T., Senda, T., Wang, X., Deng, Z., Abe, I., Dickschat J.S., and Liu, T. Nature 606, 414-419 (2022).
EMDB-32531@3.17Å (PDB:7wij) (EMPIAR-11409)
EMDB-32532@4.00Å (PDB:----) (EMPIAR-11409)

□ Structural basis of the strict specificity of a bacterial GH31 α-1,3-glucosidase for nigerooligosaccharides.
Ikegaya, M., Moriya, T., Adachi, N., Kawasaki, M., Park, E.Y., and Miyazaki, T. J. Biol. Chem. 298, 101827 (2022).
EMDB-32571@2.73Å (PDB:7wlg) (EMPIAR-11171)

□ C-Glycoside metabolism in the gut and in nature: Identification, characterization, structural analyses and distribution of C-C bond-cleaving enzymes.
Mori, T., Kumano, T., He, H., Watanabe, S., Senda, M., Moriya, T., Adachi, N., Hori, S., Terashita, Y., Kawasaki, M., Hashimoto, Y., Awakawa, T., Senda, T., Abe, I., and Kobayashi, M. Nature Commun. 12, 6294 (2021).
EMDB-30808@2.85Å (PDB:7drd) (EMPIAR-11124)
EMDB-30809@2.54Å (PDB:7dre) (EMPIAR-11138)

□ Non-conventional octameric structure of C-phycocyanin.
Minato, T., Teramoto, T., Adachi, N., Hung, N.K., Yamada, K., Kawasaki, M., Akutsu, M., Moriya, T., Senda, T., Ogo, S., Kakuta, Y., and Yoon, K.S. Commun. Biol. 4, 1238 (2021).
EMDB-31090@3.06Å (PDB:7eh8) (EMPIAR-11079)
EMDB-31089@3.71Å (PDB:7eh7) (EMPIAR-11079)

□ Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing Giardia lamblia histones.
Sato, S., Takizawa, Y., Hoshikawa, F., Dacher, M., Tanaka, H., Tachiwana, H., Kujirai, T., Iikura, Y., Ho, C.H., Adachi, N., Patwal, I., Flaus, A., and Kurumizaka, H. Nucleic Acids Res. 49, 8934-8946 (2021).
EMDB-30591@3.57Å @TokyoU-Titan (PDB:7d69)

□ Minimal protein-only RNase P structure reveals insights into tRNA precursor recognition and catalysis.
Teramoto, T., Koyasu, T., Adachi, N., Kawasaki, M., Moriya, T., Numata, T., Senda, T., and Kakuta, Y. J. Biol. Chem. 297, 101028 (2021).
EMDB-31432@3.62Å (PDB:7f3e) (EMPIAR-11072)

□ 2.85 and 2.99 Å resolution structures of 110 kDa nitrite reductase determined by 200 kV cryogenic electron microscopy.
Adachi, N., Yamaguchi, T., Moriya, T., Kawasaki, M., Koiwai, K., Shinoda, A., Yamada, Y., Yumoto, F., Kohzuma, T., and Senda, T. J. Struct. Biol. 213, 107768 (2021).
EMDB-0730@2.99Å (PDB:6knf) (EMPIAR-10580)
EMDB-0731@2.85Å (PDB:6kng) (EMPIAR-10581)

□ DNA polymerase D temporarily connects primase to the CMG-like helicase before interacting with proliferating cell nuclear antigen.
Oki, K., Yamagami, T., Nagata, M., Mayanagi, K., Shirai, T., Adachi, N., Numata, T., Ishino, S., and Ishino Y. Nucleic Acids Res. 49, 4599-4612 (2021).
EMDB-30937@7.1Å (PDB:----) (EMPIAR-11061)

□ Structural and functional analyses of the tridomain-nonribosomal peptide synthetase FmoA3 for 4-methyloxazoline ring formation.
Katsuyama, Y., Sone, K., Harada, A., Kawai, S., Urano, N., Adachi, N., Moriya, T., Kawasaki, M., Shin-Ya, K., Senda, T., and Ohnishi, Y. Angew. Chem. 60, 14554-14562 (2021).
EMDB-30440@3.55Å (PDB:----) (EMPIAR-11059)

□ Cryo-EM structure of K+-bound hERG channel complexed with the blocker astemizole.
Asai, T., Adachi, N., Moriya, T., Oki, H., Maru, T., Kawasaki, M., Suzuki, K., Chen, S., Ishii, R., Yonemori, K., Igaki, S., Yasuda, S., Ogasawara, S., Senda, T., and Murata, T. Structure 29, 203-212 (2021).
EMDB-30412@3.90Å (PDB:7cn0) (EMPIAR-10628)
EMDB-30413@3.70Å (PDB:7cn1) (EMPIAR-10629)

□ Structural analysis reveals TLR7 dynamics underlying antagonism.
Tojo, S., Zhang, Z., Matsui, H., Tahara, M., Ikeguchi, M., Kochi, M., Kamada, M., Shigematsu, H., Tsutsumi, A., Adachi, N., Shibata, T., Yamamoto, M., Kikkawa, M., Senda, T., Isobe, Y., Ohto, U., and Shimizu, T. Nature Commun. 11, 5204 (2020).
EMDB-30002@2.8Å @TokyoU-Titan (PDB:6lw1)

□ Crystallographic and cryogenic electron microscopic structures and enzymatic characterization of sulfur oxygenase reductase from Sulfurisphaera tokodaii.
Sato, Y., Yabuki, T., Adachi, N., Moriya, T., Arakawa, T., Kawasaki, M., Yamada, C., Senda, T., Fushinobu, S., and Wakagi, T. J. Struct. Biol. X. 4, 100030 (2020).
EMDB-30073@2.24Å (PDB:6m3x) (EMPIAR-10546)
EMDB-30362@2.05Å (PDB:----) (EMPIAR-10546)

KEKユーザーによる施設利用の成果
□ Identifying antibiotics based on structural differences in the conserved allostery from mitochondrial heme-copper oxidases.
Nishida, Y., Yanagisawa, S., Morita, R., Shigematsu, H., Shinzawa-Itoh, K., Yuki, H., Ogasawara, S., Shimuta, K., Iwamoto, T., Nakabayashi, C., Matsumura, W., Kato, H., Gopalasingam, C., Nagao, T., Qaqorh, T., Takahashi, Y., Yamazaki, S., Kamiya, K., Harada, R., Mizuno, N., Takahashi, H., Akeda, Y., Ohnishi, M., Ishii, Y., Kumasaka, T., Murata, T., Muramoto, K., Tosha, T., Shiro, Y., Honma, T., Shigeta, Y., Kubo, M., Takashima, S., and Shintani, Y. Nature Commun. 13, 7591 (2022).

□ Design and lyophilization of lipid nanoparticles for mRNA vaccine and its robust immune response in mice and nonhuman primates.
Suzuki, Y., Miyazaki, T., Muto, H., Kubara, K., Mukai, Y., Watari, R., Sato, S., Kondo, K., Tsukumo, S.I., Yasutomo, K., Ito, M., and Tsukahara, K. Mol. Ther. Nucleic Acids 30, 226-240 (2022).

□ Syntheses and aggregation properties of new squalene receptors bearing open chain ligands.
Linh, T.N., Arimura, T., Tominaga, K., Kigoshi, H., and Isoda, H. Supramolecular Chemistry 33, 194-201 (2021).

KEKメンバーによる高度化研究の成果
□ Size matters: optimal mask diameter and box size for single-particle cryogenic electron microscopy.
Moriya, T., Adachi, N., Kawasaki, M., Yamada, Y., Shinoda, A., Koiwai, K., Yumoto, F., and Senda, T. bioRxiv (2020).

KEKクライオ電顕の利用統計

FY2018 (182 days) (431 grids)Talos
　外部利用　アカデミア　087 days (47.8%) ＝＝＝＝＝ (23 groups)
　外部利用　企業　　　　021 days (11.5%) ＝ (2 groups + trial use 11 groups)
　内部利用　　　　　　　024 days (13.2%) ＝
　メンテナンス　　　　　036 days (19.8%) ＝＝
　休止　　　　　　　　　014 days (07.7%) ＝

FY2019 (366 days) (1107 grids)Talos
　外部利用　アカデミア　185 days (50.5%) ＝＝＝＝＝ (28 groups)
　外部利用　企業　　　　047 days (12.8%) ＝ (8 groups)
　内部利用　　　　　　　025 days (06.8%) ＝
　メンテナンス　　　　　068 days (18.6%) ＝＝
　休止　　　　　　　　　041 days (11.2%) ＝

FY2020 (365 days) (1101 grids)Talos
　外部利用　アカデミア　167 days (45.8%) ＝＝＝＝ (22 groups + trial use 17 groups)
　外部利用　企業　　　　043 days (11.8%) ＝ (10 groups)
　内部利用　　　　　　　024 days (06.6%) ＝
　メンテナンス　　　　　067 days (18.4%) ＝＝
　休止　　　　　　　　　031 days (08.5%) ＝
　閉鎖　　　　　　　　　033 days (09.0%) ＝

FY2021 (365 days) (1451 grids)Talos
　外部利用　アカデミア　167 days (45.8%) ＝＝＝＝＝ (35 groups + trial use 3 groups)
　外部利用　企業　　　　066 days (18.1%) ＝＝ (11 groups)
　内部利用　　　　　　　033 days (09.0%) ＝
　メンテナンス　　　　　041 days (11.2%) ＝
　休止　　　　　　　　　034 days (09.3%) ＝
　移設　　　　　　　　　024 days (06.6%)

FY2022 (365 days) Talos
　外部利用　アカデミア　156 days (42.7%) ＝＝＝＝ (43 groups)
　外部利用　企業　　　　057 days (15.6%) ＝＝(6 groups)
　内部利用　　　　　　　061 days (16.7%) ＝＝
　メンテナンス　　　　　024 days (06.6%)
　休止　　　　　　　　　057 days (15.6%) ＝＝
　移設　　　　　　　　　010 days (05.5%)

FY2023 (366 days) Talos
　外部利用　アカデミア　092 days (25.1%) (26 groups)
　外部利用　企業　　　　023 days (06.3%) (4 groups)
　内部利用　　　　　　　043 days (11.7%)
　メンテナンス　　　　　024 days (06.6%)
　休止　　　　　　　　　184 days (50.3%)

FY2023 (305 days :6月〜) Titan
　外部利用　アカデミア　061 days (20.0%) (17 groups)
　外部利用　企業　　　　050 days (16.4%) (5 groups)
　内部利用　　　　　　　034 days (11.1%)
　メンテナンス　　　　　024 days (07.9%)
　休止　　　　　　　　　136 days (44.6%)

FY2024 (365 days) Talos

　外部利用　アカデミア　090 days (24.7%) ( 16groups)
　外部利用　企業　　　　013 days (3.6%) ( 3groups)
　内部利用　　　　　　　048 days (13.2%)
　メンテナンス　　　　　024 days (3.8%)
　休止　　　　　　　　　184 days (54.8%)


　FY2024 (365days ) Titan

　外部利用　アカデミア　083 days (22.7%) ( 19groups)
　外部利用　企業　　　　075 days (20.5%) ( 9groups)
　内部利用　　　　　　　051 days (14.2%)
　メンテナンス　　　　　024 days (4.1%)
　休止　　　　　　　　　136 days (38.4%)



装置稼働日のみに注目した場合の利用統計
　FY2018 (132 days)
　外部利用　アカデミア　087 days (65.9%) ＝＝＝＝＝＝ (23 groups)
　外部利用　企業　　　　021 days (15.9%) ＝＝ (2 groups + trial use 11 groups)
　内部利用　　　　　　　024 days (18.2%) ＝＝
　FY2019 (257 days)
　外部利用　アカデミア　185 days (72.0%) ＝＝＝＝＝＝＝ (28 groups)
　外部利用　企業　　　　047 days (18.3%) ＝＝ (8 groups)
　内部利用　　　　　　　025 days (09.7%) ＝
　FY2020 (234 days)
　外部利用　アカデミア　167 days (71.4%) ＝＝＝＝＝＝＝ (22 groups + trial use 17 groups)
　外部利用　企業　　　　043 days (18.4%) ＝＝ (10 groups)
　内部利用　　　　　　　024 days (10.3%) ＝
　FY2021 (266 days)
　外部利用　アカデミア　167 days (62.8%) ＝＝＝＝＝＝ (35 groups + trial use 3 groups)
　外部利用　企業　　　　066 days (24.8%) ＝＝＝ (11 groups)
　内部利用　　　　　　　033 days (12.4%) ＝
　FY2022 (274 days)
　外部利用　アカデミア　156 days (56.9%) ＝＝＝＝＝ (43 groups)
　外部利用　企業　　　　057 days (20.8%) ＝＝ (6 groups)
　内部利用　　　　　　　061 days (22.3%) ＝＝＝
　FY2023 (158 days) Talos
　外部利用　アカデミア　092 days (58.2%) (26 groups)
　外部利用　企業　　　　023 days (14.6%) (4 groups)
　内部利用　　　　　　　043 days (27.2%)
　FY2023 (145 days :6月〜) Titan
　外部利用　アカデミア　061 days (42.1%) (17 groups)
　外部利用　企業　　　　050 days (34.5%) (5 groups)
　内部利用　　　　　　　034 days (23.4%)

FY2024 (151 days) Talos

　外部利用　アカデミア　090 days (59.6%) ( 16groups)
　外部利用　企業　　　　013 days (8.6%) ( 3groups)
　内部利用　　　　　　　048 days (31.3%)

FY2024 (209days ) Titan

　外部利用　アカデミア　083 days (39.5%) ( 19groups)
　外部利用　企業　　　　075 days (35.7%) ( 9groups)
　内部利用　　　　　　　051 days (24.8%)



トレーニング関連
　04日間初期トレーニング　　17回開催　通算　アカデミア38グループ・企業4社 が受講
　10日間中級者トレーニング　06回開催　通算　アカデミア4名・企業2名 が受講
　02日間初心者解析講習会　　07回開催　通算　339名 が受講（内訳：43+44+42+49+56+46+59名）
　02日間中級者解析講習会　　08回開催　通算　073名 が受講（内訳：05+11+11+11+10+10+8+7名）

装置紹介

クライオ電子顕微鏡1
　名称　　　Talos Arctica G2
　加速電圧　200kV
　電子銃　　XFEG
　ステージ　AutoGrid挿入型サイドエントリーステージ
　位相板　　Volta Phase Plate
　旧検出器　Falcon 3EC（*92k=1.13Å/px, 120k=0.88Å/px, 150k=0.69Å/px）
　検出器１　Falcon 4 （*92k=1.08Å/px, 120k=0.84Å/px, 150k=0.66Å/px）
　検出器２　Ceta 16M
　ソフト　　EPU, EPU-D

クライオ電子顕微鏡2
　名称　　　Titan Krios G4
　加速電圧　300kV
　電子銃　　XFEG
　ステージ　AutoGrid挿入型サイドエントリーステージ
　位相板　　Volta Phase Plate
　エナジーフィルター　Selectris-X
　検出器１　Falcon 4i （*130k=0.96Å/px, 165k=0.75Å/px, 215k=0.58Å/px, 270k=0.46Å/px）
　検出器２　Ceta-D
　ソフト　　EPU, EPU-D

グリッド凍結装置
　名称　　　Vitrobot Mark IV

親水化装置
　名称　　　PIB-10
　電流値　　soft mode = ~7mA, hard mode = ~11mA

KEKクライオ電顕で得られたmap（*分解能順）

可溶性蛋白質（*5Å以上のmapが72種類、得られています (apoferritinを除く)）
　1.99Å　480kDa　O　千田Gr　ftnA　[--]　2層graphen gridを使って測定
　2.24Å　860kDa　O　伏信Gr　StSOR　[JSB-X 2020]　Relion3.1で再解析して2.05Å
　2.42Å　443kDa　O　胡桃坂/滝沢Gr　Apoferritin　[--]　装置立ち上げ時にご協力頂きました
　2.54Å　250kDa　D2　阿部Gr　EuCGD　[Nat Comm 2021]　--
　2.60Å　940kDa　D7　TBA　TBA　[--]　cryoSPARCで解析
　2.60Å　280kDa　D2　TBA　TBA　[--]　--
　2.73Å　516kDa　D3　宮崎Gr　GH31_u1　[JBC 2022]　--
　2.85Å　110kDa　C3　高妻/山口Gr　AcNIR (pH8.1)　[JSB 2021]　--
　2.85Å　250kDa　D2　阿部Gr　PuCGD　[Nat Comm 2021]　--
　2.86Å　189kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--
　2.9Å　???kDa+　C1　Industry　--　成果非公開　--
　2.91Å　400kDa　D2　宮川Gr　CphA1　[Nat Comm 2022]　--
　2.93Å　400kDa+　D2　宮川Gr　CphA1+ATPgS　[Nat Comm 2022]　--
　2.99Å　110kDa　C3　高妻/山口Gr　AcNIR (pH6.2)　[JSB 2021]　--
　2.99Å　250kDa+　D2　阿部Gr　PuCGD+ATP　[--]　--
　2.99Å　480kDa　O　千田/川崎Gr　ftnA　[--]　--
　2.99Å　88kDa　C2　千田Gr　BphA4　[--]　--
　
　3Å　500kDa+　C1　Industry　--　成果非公開　東大Titanで2.5Å
　3Å　4000kDa+　C1　Industry　--　成果非公開　阪大Titanで2.75Å
　3.02Å　192kDa　D2　TBA　TBA　[--]　--
　3.03Å　168kDa　C2　TBA　TBA　[--]　--
　3.06Å　240kDa　D3　角田Gr　CPC-6mer　[Comm Biol 2021]　--
　3.07Å　176kDa　C2　TBA　TBA　[--]　--
　3.15Å　168kDa+　C2　TBA　TBA　[--]　東大Titanで2.57Å
　3.17Å　480kDa　D3　阿部Gr　 MpMS　[Nature 2022]　--
　3.2Å　310kDa　D2　Industry　--　成果非公開　東大Titanで追加測定
　3.23Å　500kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--
　3.26Å　160kDa　C2　TBA　TBA　[--]　--
　3.27Å　110kDa　C3　高妻/山口Gr　AcNIR (pH8.8)　[--]　--
　3.29Å　300kDa　D2　TBA　TBA　[--]　Linearで測定。東大Titanで1.8Å
　3.3Å　800kDa　D7　TBA　TBA　[--]　cryoSPARCで解析
　3.33Å　210kDa　C1　TBA　TBA　[in preparation]　--
　3.36Å　480kDa+　D2　TBA　TBA　[in preparation]　--
　3.4Å　120kDa　C3　Industry　--　成果非公開　--
　3.40Å　450kDa　O　TBA　TBA　[--]　--
　3.45Å　390kDa　D3　TBA　TBA　[--]　--
　3.49Å　650kDa　C1　 TBA　TBA　[--]　--
　3.5Å　110kDa+　C1　Industry　--　成果非公開　--
　3.52Å　200kDa　C2　TBA　TBA　[--]　cryoSPARCで3.39Å
　3.55Å　240kDa　C2　大西/勝山Gr　FmoA3　[Angew Chem 2021]　--
　3.56Å　180kDa+　C2　TBA　TBA　[--]　東大Titanで2.86Å
　3.58Å　3400kDa　D6　 TBA　TBA　[--]　--
　3.6Å　200kDa　C2　 TBA　TBA　[--]　--
　3.62Å　270kDa　C2　角田/寺本/沼田Gr　Aq880　[JBC 2021]　--
　3.62Å　510kDa+核酸　C1　TBA　TBA　[--]　--
　3.63Å　480kDa+　D2　TBA　TBA　[in preparation]　--
　3.64Å　210kDa+　C1　TBA　TBA　[in preparation]　東大Titanで2.77Å
　3.71Å　320kDa　D4　角田Gr　CPC-8mer　[Comm Biol 2021]　--
　3.78Å　???kDa+核酸　C1　TBA　TBA　[--]　--
　3.82Å　210kDa+　C1　TBA　TBA　[in preparation]　--
　3.84Å　146kDa　D2　Industry　--　成果非公開　東大Titanで追加測定
　3.94Å　180-240kDa　D3　 TBA　TBA　[--]　--
　3.96Å　1100kDa　I　新井/川上/宮本Gr　mTIP60-Ba　[JACS 2022]　--
　
　4.00Å　480kDa+　C1　阿部Gr　MpMS crosslink　[Nature 2022]　--
　4.05Å　168kDa+　C2　TBA　TBA　[--]　--
　4.13Å　260kDa　D5　TBA　TBA　[--]　--
　4.13Å　150kDa+核酸　C1　TBA　TBA　[--]　播磨cryoARM300で2.9Å
　4.17Å　270kDa+核酸　C2　TBA　TBA　[--]　--
　4.19Å　300kDa　D4　Industry　--　成果非公開　Linearで測定
　4.29Å　200kDa　C2　清水/大戸Gr　TLR7　[Nat Comm 2020]　東大Titanで2.89Å
　4.31Å　240kDa　D2　TBA　TBA　[--]　Linearで測定
　4.31Å　220kDa　D2　Industry　--　成果非公開　Linearで測定
　4.32Å　270kDa+核酸　C2　TBA　TBA　[in preparation]　--
　4.40Å　480kDa　D2　TBA　TBA　[in preparation]　--
　4.40Å　520kDa　D3　TBA　TBA　[--]　--
　4.42Å　1800kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--
　4.45Å　180kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--
　4.48Å　480kDa　D3　Industry　--　成果非公開　Linearで測定
　4.56Å　160kDa+核酸　C1　胡桃坂/滝沢Gr　GlNucleosome　[NAR 2021]　東大Titanで3.57Å
　4.58Å　330kDa+核酸　C1　TBA　TBA　[--]　--
　4.62Å　350kDa+　C2　TBA　TBA　[--]　Linearで測定
　4.80Å　240kDa　C2　TBA　TBA　[--]　Linearで測定
　4.98Å　220kDa　C1　TBA　TBA　[in preparation]　cryoSPARCで解析
　
　5.04Å　220kDa　D4　TBA　TBA　[--]　--
　5.30Å　220kDa　C1　TBA　TBA　[in preparation]　cryoSPARCで解析
　6.63Å　950kDa　D8　TBA　TBA　[--]　--
　7.04Å　246kDa　C2　TBA　TBA　[--]　--
　7.1Å　318kDa　C1　石野/沼田/真柳Gr　DNA PolD+primase　[NAR 2021]　--
　7.14Å　400kDa+　C1　宮川Gr　CphA1+ATPgS+Asp+peptide　[Nat Comm 2022]　東大Titanで2.53Å
　8.5Å　600kDa　C1　TBA　TBA　[submitted]　--
　9.80Å　???kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--
　13.44Å　150kDa+核酸　C1　TBA　TBA　[--]　東大Titanで3.29Å
　20Å　???kDa　C1　TBA　TBA　[in preparation]　阪大Titanで~3Å
　

膜蛋白質（*5Å以上のmapが5種類、得られています）
　3.13Å　330kDa　C11　TBA　TBA　[accepted]　--
　3.41Å　700kDa+　C1　TBA　TBA　[in preparation]　東大Titanで追加測定
　3.67Å　165kDa　C3　TBA　TBA　[in preparation]　--
　3.7Å　350kDa+　C1　クライオ電顕勉強会　hERG+astemizole　[Structure 2021]　--
　3.9Å　350kDa　C4　クライオ電顕勉強会　hERG　[Structure 2021]　--
　
　6.59Å　500kDa　C1　TBA　TBA　[--]　東大Titanで4.3-4.4Å
　6.82Å　500kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--
　7.73Å　170kDa+　C1　TBA　TBA　[in preparation]　東大Titanで2.93Å
　20Å　400kDa　C1　TBA　TBA　[--]　--

来所先・送付先に関する情報

KEKクライオ電顕を用いたデータ測定にお越しになる方はこちらのpdfをご覧いただき、クライオ電顕実験棟までお越しください。

サンプル・HDD・ドライシッパーなどの送付は下記住所までお願いいたします。

　〒305-0801　茨城県つくば市大穂1-1
　高エネルギー加速器研究機構　クライオ電顕実験棟
　tel: 029-879-6303,　fax: 029-879-6179

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