物構研が所属する高エネルギー加速器研究機構(KEK)は、大学共同利用機関法人です。個々の大学では維持が難しい大型の加速器や研究設備を、国内外の大学や公的研究機関の研究者に無償で提供しています。加速器から得られる量子ビームを用いた物性物理、化学、生物学、医学、材料工学など、広い分野の研究者に利用される物構研は、年間約4,000名の研究者を受け入れています。
実験施設の利用は無償で、採択された研究課題に対しては旅費などの支援が行われます。また、宿泊施設や図書室なども利用できます。
またフォトンファクトリーは設立早期から企業の方にも大変多く利用されてきており、産業界のイノベーション創成や人材の育成にも貢献してきています。